* Mancanza di mitocondri: Pelomyxa palustris è unico in quanto manca di mitocondri, i powerhous delle cellule eucariotiche. Ciò ha portato alcuni a credere che rappresenti una fase iniziale dell'evoluzione eucariotica. Tuttavia, è più probabile che Pelomyxa abbia perso i suoi mitocondri attraverso la perdita secondaria, un processo in cui un organismo perde una caratteristica che era presente nei suoi antenati.
* Presenza di batteri: Invece dei mitocondri, Pelomyxa contiene batteri simbiotici che svolgono molte delle funzioni che i mitocondri di solito fanno. Ciò suggerisce che Pelomyxa ha evoluto il suo sistema energetico unico dopo essersi ramificato da altri eucarioti, non prima.
* Complessità evolutiva: La storia evolutiva degli eucarioti è complessa e coinvolge più lignaggi che si ramificano da un antenato comune. È difficile identificare un singolo organismo "più primitivo".
* Mancanza di uno stato "primitivo" definitivo: Il concetto di "primitivo" può essere fuorviante. Gli organismi non diventano necessariamente più complessi nel tempo. L'evoluzione non è una progressione lineare, ma un processo di ramificazione in cui diversi lignaggi si adattano ai loro ambienti in modi unici.
Pertanto, mentre Pelomyxa palustris è certamente un organismo interessante e unico, non è necessariamente l'eucario più primitivo. La sua mancanza di mitocondri potrebbe essere un tratto derivato, non primitivo.
Invece di concentrarsi sulla "primitività", è più accurato considerare Pelomyxa come un esempio di come i processi evolutivi possano portare a adattamenti diversi e affascinanti, anche in organismi apparentemente semplici.
