1. Sugar: Il DNA contiene zucchero desossiribosio, mentre l'RNA contiene zucchero al ribosio. La differenza sta in presenza di un gruppo idrossilico (-OH) sul carbonio 2 'del ribosio, che è assente nel desossiribosio. Questa sottile differenza influisce sulla stabilità e la reattività della molecola.

2. Base azotate: Sia il DNA che l'RNA contengono adenina (A), guanina (G) e citosina (C). Tuttavia, il DNA contiene la timina (T), mentre l'RNA contiene invece uracile (U). Uracile manca di un gruppo metilico presente nella timina.

3. Struttura: Il DNA è un'elica a doppio filamento, con due fili anti-paralleli tenuti insieme da legami idrogeno tra coppie di basi complementari (A-T e G-C). L'RNA è in genere a singolo filamento, sebbene possa piegarsi in strutture tridimensionali complesse a causa dell'accoppiamento di base intramolecolare.

Queste differenze nella struttura portano ai loro ruoli distinti nella cellula:il DNA funge da progetto genetico, mentre l'RNA svolge vari ruoli nell'espressione genica, come il trasporto di informazioni genetiche dal DNA ai ribosomi per la sintesi proteica.