I funghi sono un gruppo diversificato di organismi e la loro classificazione è stata soggetta a cambiamenti nel tempo. Attualmente, la classificazione più ampiamente accettata divide i funghi in sette gruppi principali:

1. Chytridiomycota (chytrids)

- Questi sono i funghi più primitivi, con spore flagellate (zoospore).

- Molti sono acquatici, ma alcuni vivono nel suolo o sulle piante.

- Alcuni chytridi sono parassiti di piante, animali e altri funghi.

2. Blastocladiomycota

- Questi sono simili ai chytridi ma hanno un ciclo di vita unico e diverse strutture cellulari.

- Sono spesso saprobi di materia organica, in particolare acquatica.

3. Neocallimastigomycota

- Questi sono funghi anaerobici trovati nei tratti digestivi degli animali erbivori.

- svolgono un ruolo nel rompere il materiale vegetale.

4. Glomeromycota

- Questi sono simbionti obbligatori che formano micorrize arbuscolari con radici vegetali.

- Forniscono alle piante nutrienti, in particolare il fosforo.

5. Ascomycota (funghi SAC)

- Questo è il più grande gruppo di funghi, con oltre 64.000 specie.

- Producono spore in una struttura simile a un sacco chiamato ASCUS.

- Gli ascomiceti includono lieviti, tartufi, mores e molti agenti patogeni delle piante.

6. Basidiomycota (funghi del club)

- Questi funghi producono spore su strutture a forma di club chiamate Basidia.

- Basidiomycetes includono funghi, toadstools, puffo e ruggine.

7. Microsporidia

- Questi sono parassiti intracellulari obbligatori degli animali, compresi gli esseri umani.

- Si distinguono per le loro piccole dimensioni e le spore uniche.

Nota: Esistono altri gruppi fungini che sono meno ben caratterizzati e la classificazione è in costante evoluzione man mano che vengono fatte nuove scoperte.