Le due fasi principali della respirazione si verificano in diverse posizioni all'interno della cella:

* Glycolisi: Questo primo stadio si verifica nel citoplasma della cella.

* Ciclo di Krebs e catena di trasporto di elettroni: Queste fasi si verificano nei mitocondri , in particolare all'interno della matrice e della membrana interna dei mitocondri, rispettivamente.