Ha sviluppato un sistema di classificazione degli organismi basati sulle loro caratteristiche condivise, noto come tassonomia linnaea . Questo sistema utilizza una classificazione gerarchica, con organismi raggruppati in categorie sempre più specifiche:
* Kingdom
* phylum
* Classe
* Ordine
* Famiglia
* Genere
* Specie
Il lavoro di Linnaeus, pubblicato nel suo libro Systema Naturae Nel 1735, gettò le basi per il moderno sistema di classificazione biologica ed è ancora usato come base per comprendere le relazioni tra gli esseri viventi.