* Mitocondri: Questi sono i powerhous della cellula, responsabili della respirazione cellulare e della produzione di ATP. Si pensa che abbiano avuto origine da batteri aerobici che sono stati inghiottiti dalle prime cellule eucariotiche. Le prove di questa teoria includono il fatto che i mitocondri hanno il loro DNA, che è distinto dal DNA nucleare della cellula e che si replicano in modo indipendente.
* Cloroplasti: Trovati solo nelle cellule vegetali, i cloroplasti sono responsabili della fotosintesi. Si ritiene che abbiano avuto origine da batteri fotosintetici, probabilmente cianobatteri, che sono stati inghiottiti dalle prime cellule eucariotiche. Simile ai mitocondri, i cloroplasti hanno il proprio DNA e si replicano in modo indipendente.
Questa teoria dell'origine degli organelli è nota come teoria endosimbiotica . È una spiegazione ampiamente accettata per l'evoluzione delle cellule eucariotiche ed è supportata da un ampio corpus di prove.