* Le sonde del DNA funzionano per ibridazione: Si legano a sequenze complementari in una molecola di DNA target.
* La specificità proviene dall'accoppiamento di base: Le quattro basi nucleotidiche (adenina, timina, guanina, citosina) si accoppiano specificamente (a con t, g con c).
* Sequenze uniche: Ogni sonda di DNA è progettata per avere una sequenza che corrisponde a una regione unica del DNA bersaglio.
Pensaci come un blocco e una chiave:
* La sonda DNA è la chiave e il DNA target è il blocco.
* La sequenza specifica della sonda è la forma della chiave e solo una sequenza di corrispondenza sul DNA target gli consentirà di legarsi.
Altri fattori possono influenzare la forza del legame, ma il determinante principale della specificità è la sequenza della sonda.