1. Reclutamento di fattori di trascrizione:
* Meccanismo: Le proteine legate al potenziatore possono interagire direttamente con e reclutare altri fattori di trascrizione (TF) nella regione del promotore del gene. Questi TF si legano spesso a specifiche sequenze di DNA all'interno del promotore, iniziando l'assemblaggio del complesso di pre-inizio della trascrizione (PIC).
* Esempio: Il CREB proteico (proteina legante dell'elemento di risposta cAMP) può legarsi a un elemento di risposta cAMP (CRE) all'interno di un potenziatore. Se attivato da percorsi di segnalazione, CREB recluta altri TF come CBP (proteina legante CREB) al promotore, portando ad una maggiore trascrizione.
2. Rimodellamento della cromatina:
* Meccanismo: Le proteine legate al potenziatore possono reclutare enzimi che modificano la struttura della cromatina, rendendo il DNA più accessibile ai macchinari trascrizionali. Questo può comportare:
* Acetilazione dell'istone: Aggiunta di gruppi di acetil a code di istone, allentando la presa degli istoni sul DNA e promuovendo la trascrizione.
* Metilazione dell'istone: Aggiunta di gruppi metilici a code di istone, che possono attivare o reprimere la trascrizione a seconda del residuo di lisina specifico modificato.
* Esempio: La proteina SWI/SNF è un complesso di rimodellamento della cromatina che può essere reclutato in potenziatori da TFS specifici. SWI/SNF rimodella quindi i nucleosomi nella regione del promotore, consentendo ad altri TF e RNA polimerasi di accedere al DNA e iniziare la trascrizione.
3. Looping e prossimità:
* Meccanismo: I potenziatori possono trovarsi lontano dai geni che regolano, ma le proteine legate ai potenziatori possono interagire con le proteine legate alla regione del promotore, formando un ciclo nel DNA. Ciò porta il potenziatore nelle immediate vicinanze del promotore, facilitando il reclutamento di TFS e l'inizio della trascrizione.
* Esempio: Cohesin e CTCF sono proteine che svolgono un ruolo nella formazione di loop di DNA. CTCF si lega a specifiche sequenze di DNA, mentre la coesina funge da ponte per collegare queste sequenze, creando loop e avvicinando i potenziatori ai loro geni target.
È importante notare che questi meccanismi spesso funzionano in concerto e la regolazione specifica di un particolare gene può comportare una complessa interazione di più proteine e percorsi.
