La definizione di specie negli eubatteri (nota anche come batteri) è un argomento complesso e dibattuto. Non esiste una definizione singola, universalmente accettata, a differenza degli eucarioti in cui è possibile applicare il concetto di specie biologiche (basato sull'interbreeeding). Questo perché i batteri si riproducono asessualmente e possono trasferire il materiale genetico in orizzontale, rendendo meno rilevante il concetto tradizionale di "incroci".

Ecco alcuni concetti chiave usati nella definizione delle specie batteriche:

* Concetto di specie filogenetiche: Questo concetto si basa sul raggruppamento di organismi basati sulle loro relazioni evolutive, come dedotto dai dati genetici. Le specie batteriche sono definite come lignaggi monofiletici, il che significa che condividono un antenato comune e sono distinte da altri lignaggi. Questo è l'approccio più utilizzato, ma può essere difficile definire i confini di una specie basata sulla sola somiglianza genetica.

* Concetto di specie fenotipiche: Ciò si concentra su caratteristiche osservabili, tra cui morfologia (forma), fisiologia (metabolismo) e proprietà biochimiche. Tuttavia, questo approccio è limitato perché molti batteri condividono tratti simili e possono mostrare una significativa variazione fenotipica anche all'interno di una singola specie.

* Concetto di specie ecologiche: Questo definisce le specie in base alla loro nicchia ecologica, il che significa le risorse che usano e le loro interazioni con l'ambiente. Questo approccio riconosce che i batteri possono occupare nicchie ecologiche distinte, anche se sono geneticamente simili.

* Concetto di specie genomiche: Questo concetto si concentra sul contenuto genetico complessivo di un batterio. Utilizza tecniche come l'ibridazione del DNA-DNA e il sequenziamento del genoma per confrontare l'intero genoma di diversi ceppi. Un punto di interruzione viene quindi utilizzato per definire le specie basate su un certo livello di somiglianza genetica.

È importante ricordare che:

* Non esiste una singola definizione di specie batterica universalmente accettata.

* Diverse definizioni possono portare a diverse classificazioni, a seconda delle caratteristiche sottolineate.

* L'uso di più linee di evidenza, inclusi dati filogenetici, fenotipici, ecologici e genomici, è cruciale per una comprensione globale della diversità batterica.

In definitiva, la definizione delle specie batteriche è un processo in costante evoluzione man mano che la nostra comprensione della diversità batterica e l'evoluzione migliora.