L'enzima PR-DUB è in grado di rimuovere in modo specifico il marchio dell'ubiquitina H2AK119 utilizzando un meccanismo unico. Questo meccanismo prevede l'uso di un dominio zinc finger, ovvero un dominio proteico in grado di legarsi a specifiche sequenze di DNA. L'enzima PR-DUB utilizza il suo dominio zinc finger per legarsi alla sequenza di DNA che circonda il marchio dell'ubiquitina H2AK119. Questo legame consente all'enzima PR-DUB di separare il marchio dell'ubiquitina dall'istone, rimuovendo così il marchio e ripristinando la normale funzione del complesso PRC1.
La rimozione specifica del marchio dell'ubiquitina H2AK119 da parte di PR-DUB è essenziale per il corretto funzionamento del complesso PRC1. Questo complesso è coinvolto nel silenziamento genico e la rimozione del marchio dell'ubiquitina H2AK119 consente al complesso PRC1 di legarsi e silenziare i geni bersaglio. Ciò è essenziale per la corretta regolazione dell’espressione genica e la funzione complessiva delle cellule.
