Il trattamento delle acque, chiamato anche trattamento delle acque reflue o delle acque reflue domestiche, è un processo mediante il quale gli inquinanti vengono rimossi dalle acque reflue domestiche e dagli effluenti (rifiuti scaricati da impianti industriali, abitazioni, fabbriche). Esistono vari processi utilizzati per rimuovere questi inquinanti, compresi i processi chimici e biologici, oltre a quelli fisici. L'effluente trattato risultante deve essere sufficientemente pulito da poter essere scaricato nell'ambiente o riutilizzato e smaltire i rifiuti solidi rimanenti. Gli effluenti e le acque reflue possono essere trattati in vari modi, da una fossa settica domiciliare o da sistemi di trattamento aerobico a un impianto di trattamento comunale. Quando si reca alla stazione di un comune, viene sottoposto a varie fasi di trattamento, tra cui: pre-trattamento, primario, secondario e terziario.
Pre-trattamento

Durante il pre-trattamento, i materiali facilmente rimovibili vengono separati o schermati , compresi graniglia (sabbia e ghiaia), oli, grassi e grassi e oggetti più grandi (come tamponi o scarti di materiale).
Trattamento primario

Durante il trattamento primario, l'effluente viene trasportato attraverso il chiarificatori, che sono grandi serbatoi in cui i fanghi si depositano sul fondo e i grassi e gli oli salgono verso l'alto (dove vengono scremati). Durante questo processo, i solidi e i liquidi si separano, con i solidi che si depositano sul fondo dei serbatoi. Lì possono essere raccolti e spostati e trattati separatamente.
Trattamento secondario

Durante il trattamento secondario, i processi biologici aerobici (protozoi e batteri che mangiano i contaminanti organici solubili biodegradabili) vengono utilizzati per abbattere il biologico contenuto dell'effluente (rifiuti e saponi umani o alimentari, tra le altre cose).
Terziario

Durante il trattamento terziario, la qualità dell'effluente viene aumentata attraverso pratiche di disinfezione come la clorazione o l'uso di ozono o luce ultravioletta, così come altri metodi come la filtrazione a sabbia o l'immissione di effluenti in lagune altamente aerobiche o zone umide costruite. Il cloro è economico ed efficace ma può creare composti cancerogeni e /o effluenti che sono tossici per le specie acquatiche (a meno che non siano declorati). La luce ultravioletta crea acqua più sana per l'ambiente. È mortale per batteri e virus perché altera la loro struttura genetica, rendendoli incapaci di riprodursi. Non è sempre efficace se l'acqua è torbida e i patogeni sono protetti dalla luce ultravioletta. L'ozono distrugge i patogeni perché la sua instabilità e la sua natura reattiva causano l'ossidazione della maggior parte dei materiali organici. A volte, viene utilizzata una combinazione di trattamenti terziari.