Al contrario, le molecole polari sono molecole che hanno una carica elettrica netta. Le molecole dell'acqua, ad esempio, sono molecole polari perché composte da atomi di ossigeno e idrogeno, che hanno elettronegatività diversa. Di conseguenza, le molecole d'acqua hanno un'estremità positiva e un'estremità negativa. Ciò significa che le molecole d'acqua sono attratte l'una dall'altra e non si dissolvono in molecole non polari come grassi e cloroformio.