Gli enzimi accelerano la velocità di reazione di un substrato abbassando l'energia di attivazione della reazione. Ciò viene fatto fornendo un percorso alternativo affinché la reazione abbia luogo, che richiede meno energia. Gli enzimi si legano al substrato e formano un complesso enzima-substrato, che poi subisce una serie di passaggi per convertire il substrato nel prodotto. Il complesso enzima-substrato abbassa l'energia di attivazione della reazione stabilizzando lo stato di transizione, che è il punto energetico più alto lungo il percorso della reazione. Ciò consente alla reazione di avvenire in modo più rapido ed efficiente.

Inoltre, gli enzimi possono anche aumentare la velocità della reazione aumentando la concentrazione effettiva del substrato. Ciò si ottiene legandosi al substrato e mantenendolo in prossimità del sito attivo, che è la parte dell'enzima che catalizza la reazione. Aumentando la concentrazione del substrato, l'enzima aumenta la probabilità che il substrato entri in collisione con il sito attivo e subisca una reazione.

Nel complesso, gli enzimi accelerano la reazione di un substrato diminuendo l'energia di attivazione e aumentando la concentrazione effettiva del substrato. Questi effetti consentono alla reazione di avvenire in modo più rapido ed efficiente, portando ad un aumento della velocità di reazione.