L'inquinamento del suolo ha molte cause. I contaminanti possono essere introdotti direttamente. Il suolo può essere contaminato dall'inquinamento atmosferico quando le precipitazioni depositano composti acidi come l'anidride solforosa e l'ossido di azoto. Attività umane come l'estrazione mineraria possono rilasciare un drenaggio acido, che può avere effetti diffusi. Qualunque sia la causa, l'inquinamento del suolo ha effetti negativi su piante e flora, nonché sugli organismi che dipendono da essi.
Microrganismi

I terreni acidi creati dal deposito di composti acidi come l'anidride solforosa producono un ambiente acido che non è tollerato dai microrganismi, che migliorano la struttura del suolo abbattendo il materiale organico e favorendo il flusso d'acqua.
Fotosintesi

I terreni inquinati dalla pioggia acida hanno un impatto sulle piante interrompendo la chimica del suolo e riducendo la capacità delle piante di assorbire sostanze nutritive e sottoporsi a fotosintesi.
Alluminio

Mentre l'alluminio si trova naturalmente nell'ambiente, l'inquinamento del suolo può mobilitare forme inorganiche, che sono altamente tossiche per le piante e possono potenzialmente penetrare nel terreno acqua, aumentandone gli effetti.
Algal Blooms

I terreni contaminati con alti livelli di azoto e fosforo possono penetrare nei corsi d'acqua, causando fioriture di alghe, con conseguente morte delle piante acquatiche a causa dell'esaurimento ed ossigeno disciolto.
pH

La deposizione acida nel suolo può ostacolare la sua capacità di attenuare i cambiamenti nel pH del suolo, causando la morte delle piante a causa di condizioni inospitali.