Una variazione del pH dei fluidi corporei può avere un profondo effetto sulle cellule. Il pH ottimale di diversi fluidi corporei o compartimenti varia. Il sangue arterioso ha un pH di 7,4, il liquido intracellulare un pH di 7,0 e il sangue venoso e il fluido interstiziale hanno un pH di 7,35. La scala del pH misura le concentrazioni di ioni idrogeno e poiché la misurazione è su una scala logaritmica, una differenza di 1,0 indica una differenza di 10 volte nella concentrazione di ioni idrogeno. Quando il pH nei fluidi corporei scende troppo in basso, il corpo inizia a soffrire di acidosi e quando aumenta troppo, la condizione si chiama alcalosi. L'acidosi o l'alcalosi possono essere causate da malattie o dieta.
Cellule cerebrali

Una leggera variazione del pH del liquido spinale e del liquido cerebrale durante l'acidosi provoca una riduzione dell'affinità dell'emoglobina con l'ossigeno, riducendo l'ossigeno critico fornitura alle cellule cerebrali. L'acidosi acuta provoca letargia e confusione mentale. Durante l'alcalosi o un aumento del pH, i vasi sanguigni si restringono e quindi riducono l'apporto di sangue e ossigeno alle cellule cerebrali. L'alcalosi può causare confusione, convulsioni e perdita di coscienza.
Cellule immunitarie

Quando il pH del sangue scende sotto 7,35 durante l'acidosi, le cellule immunitarie, come i macrofagi, rilasciano citochine infiammatorie, che causano infiammazione. L'acidosi compromette anche la risposta dei linfociti alla lotta contro i patogeni, con conseguente scarsa risposta immunitaria.
Cellule ossee

L'acidosi ha un effetto negativo sulle ossa, causando un aumento della perdita di calcio. Quando il pH del sangue scende al di sotto del pH 7,35, le cellule degli osteoclasti si attivano e riassorbono o distruggono l'osso. Negli esperimenti sulle cellule ossee, una goccia di pH inferiore a 0,1 ha raddoppiato la quantità di osso riassorbita dagli osteoclasti. Durante il normale rimodellamento osseo, gli osteoclasti riassorbono l'osso e l'osteoblasto costruisce l'osso. Un pH basso o acidosi inibisce l'attività di costruzione ossea degli osteoblasti, contribuendo alla perdita ossea complessiva. Con un pH elevato di 7,4 o superiore, l'attività degli osteoclasti viene soppressa.
Cellule muscolari

L'acidosi del sangue può portare alla perdita o alla degradazione muscolare. Le cellule muscolari scheletriche e cardiache sono interessate. Un basso pH deprime le contrazioni delle cellule muscolari cardiache. Anche le cellule muscolari lisce sono influenzate dall'acidosi. Ad esempio, le cellule muscolari lisce vascolari si contraggono con aumenti del pH extracellulare e si rilassano con diminuzioni del pH. Un aumento del pH extracellulare aumenta l'afflusso di calcio nelle cellule muscolari lisce vascolari, mentre una diminuzione del pH inibisce l'ingresso di calcio nelle cellule.