A prima vista, il lievito Candida krusei sembra tanto innocuo quanto i microbi:viene utilizzato per la fermentazione delle fave di cacao e dona al cioccolato il suo gradevole aroma. Ma è sempre più presente come agente patogeno nei pazienti immunocompromessi e le infezioni da C. krusei non sono sempre facili da curare. Questo lievito è naturalmente resistente al fluconazolo, un antimicotico di prima linea che è vitale non solo per il trattamento di molte infezioni fungine, ma anche per prevenirle nelle popolazioni sensibili. Nel numero di settembre di G3 , Cuomo et al. svelare la prima sequenza dell'intero genoma di un campione clinico di C. krusei, fornendo indicazioni sui geni che possono essere importanti per la resistenza al fluconazolo della specie.

Alcune bozze di assemblaggi del genoma di C. krusei erano state prodotte prima del lavoro di questi ricercatori, ma erano frammentati, un problema causato da una grande quantità di eterozigosi. La chiave del loro successo è stata quella di generare letture di sequenziamento lunghe, producendo un assemblaggio con non molti più scaffold di quelli che C. krusei ha cromosomi.

Con la loro nuova bozza in mano, Marca et al. ha cercato nel C. kruseigenome i geni associati alla patogenesi nella più familiare Candida albicans, la causa del mughetto, infezioni vaginali da lievito, e talvolta infezioni sistemiche potenzialmente letali. C. krusei, hanno trovato, ha poche copie di famiglie geniche associate alla patogenesi in C. albicans, compresi i trasportatori di oligopeptidi, aspartil proteasi, e geni della fosfolipasi B. Le specie di Candida che spesso causano malattie di solito hanno espansioni in queste famiglie di geni, quindi dato che C. krusei è raramente patogeno, questa scoperta ha senso.

Quando si sono concentrati sui geni coinvolti nella resistenza ai farmaci, il gruppo ha scoperto che C. krusei differisce da C. albicans; molti dei siti che sono spesso mutati nel bersaglio dei farmaci azolici in C. albicans resistente non sono mutati in C. krusei. Ciò implica che la resistenza naturale del lievito che fermenta il cacao al fluconazolo derivi da un meccanismo diverso da quello che comunemente consente a C. albicans di resistere ai farmaci azolici.

I ricercatori inoltre non hanno trovato il gene MDR1, che codifica per un trasportatore di farmaci spesso responsabile della resistenza a più farmaci. Loro fecero, però, trovare copie di geni correlati a CDR1, CDR2, e pochi altri che codificano altri trasportatori associati alla resistenza ai farmaci, anche se il modo in cui funzionano in C. krusei è sconosciuto. Questi geni potrebbero essere un punto di partenza per scoprire i meccanismi alla base della resistenza antimicotica in C. krusei, potenzialmente portando a migliori trattamenti e misure preventive per le popolazioni altamente vulnerabili.