Un team di ricercatori dell'Università della California ha trovato un modo per sintetizzare più geni da un gruppo di oligonucleotidi generati da microarray. Nel loro articolo pubblicato sulla rivista Scienza , il gruppo descrive la loro tecnica, chiamato DropSynth, come funziona, e i suoi svantaggi.

La sintesi dei geni è diventata così popolare che ora ci sono aziende che lo fanno per vivere, ma è ancora una proposta costosa:i metodi attuali richiedono di cucire piccoli fili in sequenze uno alla volta dopo che sono stati creati. In questo nuovo sforzo, i ricercatori segnalano un approccio one-pot alla sintesi genica che potrebbe portare a una riduzione dei costi.

Attualmente, la sintesi genica viene eseguita utilizzando un microarray, producendo DNA oligonucleotidi, che poi devono essere cuciti insieme - anche il team dell'UoC ha iniziato con un microarray, ma prima hanno dato agli oligonucleotidi una lunghezza identificativa della sequenza genica, che descrivono come un "codice a barre". Prossimo, hanno aggiunto microsfere con codici a barre complementari che potrebbero estrarre gli oligonucleotidi corrispondenti da un pool di diversi tipi di oligonucleotidi. Il risultato è stato un pool di microsfere, ognuno dei quali aveva un piccolo gruppo di oligonucleotidi dello stesso tipo attaccati. Il team ha quindi racchiuso ciascuna delle microsfere (e il suo gruppo di oligonucleotidi) in una gocciolina di emulsione usando quello che descrivono come un vortice di oligonucleotidi e miscela di olio, per 30 secondi. Dopo di che, gli enzimi hanno indotto tutti gli oligonucleotidi in una singola gocciolina a fondersi (tramite l'assemblaggio del ciclo della polimerasi), ottenendo una sequenza desiderata. Le sequenze sono state quindi rimosse dall'emulsione pronte per l'uso.

Il processo è migliore dei metodi convenzionali, il team suggerisce, poiché offre l'accesso a un pool genetico essenzialmente allo stesso costo di un pool di oligonucleotidi, non aggiunge molto. Sfortunatamente, c'è un grosso svantaggio. Il processo, notano, è "disordinato, " perché è efficiente solo per il 5% circa, non abbastanza buono per l'uso nei processi di produzione. Una nota più positiva, il metodo potrebbe essere utilizzato per creare grandi librerie di geni per vari scopi, a pochissimo costo. Potrebbe essere utilizzato anche negli sforzi di ricerca, in particolare quelli coinvolti nella progettazione delle proteine.

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