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    Progetto genetico della menta di ananas:un insieme completo del genoma
    Panoramica delle caratteristiche genomiche di M. suaveolens. a) Immagine di M. suaveolens. b) Grafico Circos delle caratteristiche genomiche prive di gap risolte dall'aplotipo di M. suaveolens. I:Lunghezza del cromosoma. II:copertura LTR/Copia. III:Elementi LTR/zingari. IV:densità genetica. V:densità della sequenza ripetuta. VI:contenuto GC. La parte più interna del grafico rappresenta la relazione collineare tra i genomi risolti con l'aplotipo di M. suaveolens. c) Posizione della regione centromerica prevista e sequenze telomeriche identificate in M. suaveolens. Credito:Ricerca sull'orticoltura (2024). DOI:10.1093/hr/uhae022

    Mentha suaveolens, comunemente nota come menta ananas, è apprezzata per il suo aroma distintivo e le proprietà medicinali, attribuite ai suoi oli essenziali.



    Nonostante la sua importanza, comprendere la base genetica di questi tratti è stata impegnativa a causa della complessità del genoma di Mentha, caratterizzato da un’elevata eterozigosi e da numerose variazioni strutturali. Uno studio completo del genoma di Mentha era essenziale per scoprire i fattori genetici che influenzano le sue caratteristiche uniche.

    I ricercatori dell'Università di medicina tradizionale cinese di Chengdu, in collaborazione con diverse altre istituzioni, sono riusciti ad assemblare con successo un genoma privo di lacune e con risoluzione degli aplotipi di Mentha suaveolens, nota anche come menta ananas.

    Utilizzando tecnologie di sequenziamento avanzate, il team ha fatto luce sulla diversità genetica e sulle variazioni strutturali all'interno del genoma, fornendo una risorsa preziosa per la futura ricerca genetica e di selezione. Lo studio è pubblicato sulla rivista Horticulture Research .

    Lo studio presenta il primo assemblaggio genomico di alta qualità, risolto in aplotipo, per Mentha suaveolens, con una dimensione del genoma di 414,3 Mb e 31.251 geni codificanti. Integrando i dati provenienti da varie piattaforme di sequenziamento, i ricercatori hanno risolto due assemblaggi aplotipici completi, ciascuno quasi completamente annotato per telomeri e centromeri.

    In particolare, l'analisi ha rivelato 41.135 variazioni strutturali, tra cui delezioni, inserzioni, duplicazioni e traslocazioni, molte delle quali influiscono sui geni coinvolti nella biosintesi dei terpenoidi.

    Una scoperta significativa è la predominanza dell'ossido di piperitenone tra i composti volatili prodotti da M. suaveolens, rispetto al mentolo, che è più comune in altre specie di Mentha.

    Lo studio ha identificato tre geni che codificano per l'isopiperitenone reduttasi (ISPR), un enzima chiave nella biosintesi del mentolo, ma ha scoperto che i loro bassi livelli di trascrizione probabilmente portano invece all'accumulo di piperitenone ossido.

    Il dottor Chi Song, uno dei principali ricercatori, ha dichiarato:"Il completamento del genoma gap-free per Mentha suaveolens rappresenta una pietra miliare significativa nella genomica vegetale. Questa mappa genetica completa fornisce una base per esplorare i meccanismi molecolari alla base delle proprietà uniche di menta ananas, che potrebbe portare ad applicazioni innovative in medicina e agricoltura."

    L'assemblaggio del genoma senza lacune di Mentha suaveolens apre la strada alla ricerca genetica e all'allevamento per migliorare le sue qualità medicinali e aromatiche. Comprendere le basi genetiche della biosintesi dei terpenoidi consente strategie mirate per ottimizzare composti preziosi come l'ossido di piperitenone.

    Questa ricerca fa avanzare la genomica vegetale e ha un potenziale significativo per migliorare la coltivazione e il valore commerciale delle specie Mentha.

    Ulteriori informazioni: Hanting Yang et al, Un assemblaggio genoma gap-free risolto da aplotipo fornisce nuove informazioni sulla diversificazione dei monoterpenoidi in Mentha suaveolens 'Variegata', Ricerca sull'orticoltura (2024). DOI:10.1093/hr/uhae022

    Informazioni sul giornale: Ricerca sull'orticoltura

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