Il riconoscimento dei codoni viene effettuato da strutture chiamate ribosomi. I ribosomi sono grandi macchine molecolari costituite da RNA e componenti proteici. Si trovano in tutte le cellule viventi e fungono da sito di sintesi proteica.
Durante la sintesi proteica, il ribosoma legge la sequenza dei codoni nella molecola di RNA e utilizza queste informazioni per determinare quali amminoacidi dovrebbero essere aggiunti alla catena proteica in crescita. Ciascun codone è riconosciuto da una specifica molecola di RNA di trasferimento (tRNA) che trasporta l'amminoacido corrispondente. La molecola di tRNA si lega al ribosoma e consegna il suo amminoacido alla catena proteica in crescita.
Combinando diversi codoni in varie sequenze, le quattro basi dell'RNA possono fornire le istruzioni per costruire proteine con 20 diversi aminoacidi. Ciò consente la sintesi di un’ampia varietà di proteine essenziali per la struttura e la funzione cellulare.