La prima cosa che i ricercatori devono fare per manipolare il DNA è estrarlo dalla cellula. Questo può essere fatto utilizzando una varietà di metodi, come l'estrazione con fenolo-cloroformio, la salatura o utilizzando un kit di estrazione del DNA. Una volta estratto, il DNA può essere utilizzato per diversi scopi, come l'amplificazione mediante PCR, la digestione con enzimi di restrizione o la clonazione genetica.