La chemiosmosi nei cloroplasti è principalmente guidata dalla traslocazione di protoni dal lume tilacoide allo stroma . Questo è il processo principale che genera la forza motrice protonica utilizzata per guidare la sintesi di ATP.

Tuttavia, esiste un altro movimento, meno significativo, di protoni che contribuisce anche al gradiente dei protoni:

* dallo spazio intermembrana allo stroma: Questo accade tramite canali di perdita di protoni Nella membrana del cloroplasto interno. Questo movimento è meno efficiente di quello primario attraverso la membrana tilacoide e il suo contributo al gradiente di proton è relativamente piccolo.

È importante ricordare che chemiosmosi nei cloroplasti è principalmente guidato dal gradiente di proton attraverso la membrana tilacoide . Il movimento dei protoni dallo spazio intermembrana allo stroma è un processo secondario che contribuisce in misura minore.