1. Ciliates: Caratterizzati dalla presenza di ciglia, cortometraggi a forma di capelli che battono ritmicamente per il movimento e l'alimentazione. Gli esempi includono *paramecium *e *stentor *.
2. Flagellates: Possedere flagelli, lunghe strutture a forma di frusta che le spingono attraverso il loro ambiente. Alcuni flagellati sono fotosintetici, mentre altri sono parassiti. Gli esempi includono * tripanosoma * (causa la malattia del sonno africana) e * giardia * (causa la giardiasi).
3. Amoebas: Distinti per i loro corpi flessibili e l'uso di pseudopodi (estensioni temporanee del citoplasma) per il movimento e il coinvolgimento del cibo. Gli esempi includono * AMoba proteus * e * entamoeba histolytica * (causa la dissenteria amebica).
4. Sporozoans: Protozoi parassiti non motili che formano spore in qualche fase del loro ciclo di vita. Spesso hanno cicli di vita complessi che coinvolgono più ospiti. Gli esempi includono * plasmodium * (causa malaria) e * tossoplasma gondii * (causa toxoplasmosi).