Tuttavia, alcuni codoni sono considerati codoni preferiti In un particolare organismo o tipo di cellula. Questi codoni preferiti sono usati più frequentemente nella sintesi proteica e possono essere più efficienti nella traduzione. I fattori che influenzano la preferenza del codone includono:
* Specie: Specie diverse hanno codoni preferiti diversi.
* Gene: All'interno di una specie, diversi geni possono avere codoni preferiti diversi.
* Tipo di cella: Anche all'interno dello stesso organismo, diversi tipi di cellule possono avere codoni preferiti diversi.
Perché esistono codoni preferiti?
* Abbondanza di tRNA: Le cellule hanno quantità variabili di diverse molecole di tRNA. I codoni che corrispondono a tRNA più abbondanti sono generalmente preferiti.
* Efficienza di traduzione: Alcuni codoni sono più efficienti per essere tradotti rispetto ad altri. Ciò può essere dovuto alla struttura del tRNA o all'interazione con il ribosoma.
Esempi di codoni preferiti:
* Negli umani, agosto è il codone iniziale più comune e UAG , uaa e uga sono i codoni di stop più comuni.
* Per la leucina aminoacida, Cua è un codone meno preferito rispetto a uua o Cug .
Conclusione:
Mentre tutti i 64 codoni sono validi, alcuni sono preferiti rispetto ad altri a seconda di fattori come specie, gene e tipo di cellula. Questi codoni preferiti sono tradotti in modo più efficiente e contribuiscono all'efficienza complessiva della sintesi proteica.