* idrolisi ATP: Le elicasi del DNA sono alimentate dall'idrolisi dell'ATP (adenosina trifosfato). Questo processo rilascia energia, che viene utilizzata per spostare l'elicasi lungo il filamento di DNA e separare i due fili. In sostanza, le "passeggiate" dell'elicasi lungo il DNA, usando l'energia dell'ATP per tenere separati i fili.
* Proteine leganti il DNA a singolo filamento (SSB): Gli SSB si legano ai singoli filamenti separati del DNA, impedendo loro di rivivere. Aiutano a stabilizzare i fili separati e impedire loro di riformulare la doppia elica.
* Topologia del DNA: L'indossatorio dell'elica del DNA introduce molta tensione. Il DNA può essere aggrovigliato, creando un "nodo" che deve essere risolto. Le topoisomerasi sono enzimi che aiutano ad alleviare questa tensione tagliando e ricongiungendosi ai fili del DNA.
* Struttura elicasi: La struttura delle stesse elicasi del DNA svolge spesso un ruolo nel tenere separati i fili. La loro forma specifica e le interazioni con il DNA possono creare una barriera tra i fili, impedendo loro di tornare insieme.
In sostanza, è una combinazione di questi fattori - input di energia, proteine leganti e la struttura dell'enzima - che lavora insieme per mantenere separati i filamenti di DNA durante la replicazione o altri processi correlati al DNA.