Ha condotto una serie di eleganti esperimenti nel 1860 usando boccette dal collo di cigno. Questi esperimenti hanno dimostrato che:
* brodo sterile rimase sterile anche se esposto all'aria, purché il collo del cigno impedisse le particelle di polvere di entrare nel brodo.
* Quando il collo era rotto , permettendo alla polvere di entrare, il brodo divenne rapidamente contaminato da microrganismi.
Ciò ha dimostrato che i microrganismi non sono derivati spontaneamente dal brodo stesso, ma sono stati invece introdotti dall'ambiente, in particolare tramite particelle di polvere.
Il lavoro di Pasteur ha rivoluzionato la nostra comprensione delle origini della vita e ha gettato le basi per la teoria dei germi della malattia.