Mentre ci sono alcune eccezioni (alcune molecole di RNA possono agire come enzimi, chiamati ribozimi), la stragrande maggioranza degli enzimi sono proteine.

Ecco perché:

* Struttura: Le proteine hanno strutture tridimensionali complesse che consentono loro di formare siti attivi specifici. Questi siti attivi sono dove l'enzima si lega al suo substrato e facilita una reazione chimica specifica.

* Specificità: Le proteine possono essere altamente specifiche nella loro funzione, legandosi solo a determinati substrati e catalizzando reazioni specifiche. Questa specificità è cruciale per la regolazione precisa dei processi biochimici all'interno delle cellule.

* Attività catalitica: La sequenza di aminoacidi di una proteina determina la sua forma e, quindi, la sua attività catalitica. La disposizione degli aminoacidi nel sito attivo consente interazioni specifiche con il substrato, promuovendo la formazione di uno stato di transizione e abbassando l'energia di attivazione della reazione.

Quindi, mentre altre molecole possono svolgere ruoli nelle reazioni biochimiche, gli enzimi sono prevalentemente realizzati in proteine.