Le strutture simili a capelli su una cellula di spugna che si muovono avanti e indietro per aiutare a spostare acqua, sostanze nutritive e rifiuti attraverso il sistema del canale sono chiamate flagella .

Questi flagelli si trovano su cellule specializzate chiamate choanociti , che fiancheggiano le camere interne della spugna. Il battito del flagello crea una corrente che attira l'acqua nella spugna, consentendo la cattura di particelle di cibo e la rimozione dei rifiuti.