Mentre alcuni enzimi sono realizzati in RNA (ribozimi), la stragrande maggioranza degli enzimi sono proteine. Le proteine sono grandi molecole complesse costituite da catene di aminoacidi. La sequenza specifica di aminoacidi determina la forma tridimensionale unica di una proteina, che a sua volta determina la sua funzione. Gli enzimi agiscono come catalizzatori, accelerando le reazioni biochimiche senza essere consumati nel processo. Le loro strutture complesse consentono loro di legarsi a molecole specifiche (substrati) e facilitare le trasformazioni chimiche.