* Biologia: Studiare cellule, tessuti e microrganismi
* Medicine: Diagnosi di malattie, esaminare il sangue e altri fluidi corporei ed eseguire la chirurgia
* Chimica: Osservare le reazioni chimiche, analizzare i materiali e studiare le strutture cristalline
* Scienza dei materiali: Esaminare la struttura e le proprietà dei materiali
* Geologia: Analisi di rocce, minerali e fossili
* Ingegneria: Ispezionando la qualità delle parti e dei componenti fabbricati
* Scienza forense: Esaminare prove come fibre, capelli e impronte digitali
* Agricoltura: Studiare piante, parassiti e malattie
Essenzialmente, qualsiasi campo in cui i dettagli dei piccoli oggetti sono importanti si basa sulla microscopia.
