1. Cloroplasti: Gli euglena sono mixotrofici, il che significa che possono ottenere energia sia dalla luce solare (fotosintesi) che dalle fonti organiche. Ciò è reso possibile dalla presenza di cloroplasti, che sono i siti della fotosintesi. Gli zooflagellati, d'altra parte, sono eterotrofici e si affidano esclusivamente al consumo di materia organica.

2. Eyespot: Conosciuto anche come lo stigma, Eyespot è un organello sensibile alla luce che aiuta Euglena a rilevare la luce e muoversi verso di essa per la fotosintesi. Gli zooflagellati non hanno gli occhi in quanto non si basano sulla fotosintesi.