1. Reazione a catena della polimerasi (PCR): Questa tecnica amplifica le regioni specifiche del DNA, consentendo il confronto tra campioni diversi. È spesso usato in combinazione con altre tecniche per confronti più specifici.
2. Polimorfismo della lunghezza del frammento di restrizione (RFLP): Questa tecnica utilizza enzimi di restrizione per tagliare il DNA a sequenze specifiche, creando frammenti di variazioni variabili. Questi frammenti vengono quindi separati dall'elettroforesi e le differenze nei modelli di banda possono indicare variazioni genetiche tra i campioni.
3. Analisi di ripetizione in tandem breve (STR): Gli STR sono sequenze di DNA brevi e ripetitive che si trovano in tutto il genoma. Questo metodo analizza la lunghezza di queste ripetizioni, che possono essere altamente variabili tra gli individui.
4. Polimorfismo a singolo nucleotide (SNP) Analisi: Gli SNP sono differenze a base singola nella sequenza del DNA. Questo metodo cerca variazioni in SNP specifici tra diverse piante, fornendo un confronto ad alta risoluzione.
5. Analisi del microsatellite: Simile all'analisi STR, i microsatelliti sono sequenze ripetitive del DNA, ma sono più lunghe degli STR. Questo metodo confronta il numero di ripetizioni in loci specifici, che possono essere altamente variabili.
6. Sequenziamento di prossima generazione (NGS): Questa tecnica avanzata consente di sequenziamento dell'intero genoma di una pianta, fornendo una visione completa del suo trucco genetico. Questo può essere usato per confrontare diversi individui o specie.
7. Impronta digitale del DNA: Questo termine viene generalmente utilizzato per fare riferimento a tecniche che producono un profilo di DNA unico per un individuo, come quelli sopra menzionati.
La tecnica specifica utilizzata dipenderà dalla domanda di ricerca e dal livello di dettaglio richiesto. Ad esempio, se si desidera confrontare la diversità genetica all'interno di una singola specie, l'analisi RFLP o STR potrebbe essere sufficiente. Tuttavia, se si desidera comprendere la relazione evolutiva tra diverse specie vegetali, NGS può essere il metodo preferito.
