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  • Come calcolare le frequenze di ricombinazione:una guida pratica

    Di Kevin Beck • Aggiornato il 30 agosto 2022

    In genetica, ogni gene esiste in due forme, o alleli , tipicamente uno dominante e uno recessivo. Ogni individuo porta due alleli per gene, uno ereditato da ciascun genitore. Quando i genotipi di entrambi i genitori sono noti, la probabilità di base consente di prevedere i genotipi e i fenotipi della prole.

    Tuttavia, l'ereditarietà nel mondo reale è complicata dalla ricombinazione , lo scambio di segmenti cromosomici durante la meiosi che rimescola gli alleli e influenza i rapporti attesi.

    Eredità mendeliana semplice

    Immagina un'ipotetica specie aliena in cui i capelli viola (P) sono dominanti su quelli gialli (p) e le teste rotonde (R) dominano le teste piatte (r). Se entrambi i genitori sono eterozigoti per entrambi i tratti (PpRr), i possibili genotipi della prole sono:PPRR, PPRr, PPrr, PpRR, PpRr, Pprr, ppRR, ppRr e pprr.

    Un quadrato di Punnett mostra un rapporto genotipico di 1:2:1:2:4:2:1:2:1, che si traduce in un rapporto fenotipico di 9:3:3:1. Cioè, su 16 bambini, ti aspetteresti 9 con capelli viola e testa tonda; 3 dai capelli viola, dalla testa piatta; 3 dai capelli gialli, dalla testa rotonda; e 1 dai capelli gialli e dalla testa piatta. Ciò si traduce in percentuali rispettivamente del 56,3%, 18,8%, 18,8% e 6,2%.

    Questi calcoli presuppongono un assortimento indipendente. Il collegamento genetico, ovvero quando due geni sono fisicamente vicini su un cromosoma, viola questo presupposto.

    Collegamento genetico:definizione

    Quando due loci sono vicini tra loro, possono essere ereditati insieme come un blocco attraverso un processo chiamato crossing over . La probabilità di ricombinazione dipende dalla distanza fisica tra i loci:più sono vicini, meno è probabile che un crossover li separi.

    Immaginatelo come se fossero amici che stanno vicini a una festa:più siete vicini, più è probabile che interagiate. Il collegamento genetico segue lo stesso principio.

    Frequenza di ricombinazione

    Per stimare la distanza fisica tra due loci utilizzando i dati sulla prole, una tecnica nota come mappatura genetica —i ricercatori confrontano i rapporti fenotipici osservati con i rapporti attesi dall'assortimento indipendente.

    In un tipico esperimento, un genitore diibrido (PpRr) viene incrociato con l'individuo doppio recessivo (pprr). Supponiamo che vengano contati 1.000 discendenti con i seguenti fenotipi:

    • Capelli viola, testa rotonda:404
    • Capelli viola, testa piatta:100
    • Capelli gialli, testa rotonda:98
    • Capelli gialli, testa piatta:398

    Poiché i geni collegati producono un eccesso di fenotipi parentali e un deficit di fenotipi ricombinanti, la frequenza di ricombinazione viene calcolata come:

    (100+98) ÷ (404+100+98+398)=0,20

    Moltiplicando per 100 si ottiene una frequenza di ricombinazione del 20%, espressa in centimorgan (cM). Una frequenza di ricombinazione inferiore indica un collegamento più stretto; una frequenza più alta suggerisce che i geni siano più distanti.

    In sintesi, i geni che mostrano un'elevata frequenza di ricombinazione sono probabilmente separati da una maggiore distanza cromosomica, mentre una bassa frequenza indica una stretta vicinanza fisica.




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