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    Il rilevamento del succinato bioluminescente monitora le diossigenasi e le demetilasi JMJC

    Demetilazione del DNA e dell'istone nel nucleosoma da parte delle demetilasi. Credito:Promega Corporation

    Un nuovo articolo di ricerca originale (e disponibile gratuitamente) pubblicato prima della stampa su Scoperta di SLAS Online descrive una nuova metodologia che consente lo studio di un gran numero di enzimi strutturalmente conservati appartenenti alla superfamiglia delle diossigenasi Fe(II)/2-ossoglutarato-dipendente. Questa superfamiglia comprende circa 60 enzimi responsabili della regolazione di un ampio numero di processi biologici inclusa la regolazione epigenetica, Riparazione del DNA/RNA e rilevamento dell'ossigeno. Di questi, JumonjiC istone lisina demetilasi (JMJCs) e prolil idrossilasi sono potenziali bersagli farmacologici a causa della loro rilevanza per le malattie umane.

    Il succinato è un prodotto comune a tutte le reazioni diossigenasi dipendenti da Fe(II)/2-ossoglutarato. Un nuovo saggio omogeneo di Alves et al. di Promega Corporation (Madison, WI) rileva il succinato utilizzando la luminescenza. Questo test consente agli scienziati di caratterizzare l'attività biochimica di qualsiasi enzima che produce succinato, indipendentemente dalla struttura chimica del substrato. Ciò dimostra l'universalità del test e i suoi vantaggi rispetto ai test che di solito dipendono dalla modifica o dall'etichettatura del substrato o del reagente necessari per catturare o monitorare il prodotto.

    Gli autori presentano una serie di applicazioni per il loro metodo. Utilizzando un formato miniaturizzato, caratterizzano l'attività enzimatica di diverse demetilasi istoniche JumonjiC e altre diossigenasi, per i quali non sono attualmente disponibili metodi di screening ad alto rendimento. Utilizzando questo semplice test di rilevamento del succinato, gli autori studiano le specificità del substrato e determinano i parametri cinetici apparenti per i diversi enzimi. Convalidano inoltre il metodo come strumento di screening per gli inibitori utilizzando la libreria di composti LOPAC 1280 e studiano la modalità d'azione di hit selezionati contro i membri di questa famiglia di enzimi.

    Il rilevamento del succinato bioluminescente è resistente alle interferenze chimiche ed è efficace per caratterizzare più diossigenasi dipendenti da Fe(II)/2-ossoglutarato con diverse strutture di substrato in un unico formato. Studiando un gran numero di questi enzimi, questo metodo potrebbe avere un impatto significativo nel campo della ricerca sulla diossigenasi.


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