I ricercatori in Giappone hanno creato un database di metaboliti da campioni di sangue raccolti da oltre 5, 000 volontari giapponesi, rendendolo disponibile gratuitamente online come una risorsa preziosa per i ricercatori di tutto il mondo.

I metaboliti e le proteine ​​controllano molti dei processi all'interno del nostro corpo, e informano anche l'interazione tra le nostre cellule e l'ambiente circostante. Comprendere questi composti e come si relazionano maggiormente tra loro, potrebbe aiutare i ricercatori a valutare lo stato di salute delle persone e sviluppare nuovi trattamenti personalizzati per varie malattie.

La banca dati, che lo scienziato bioinformatico Shu Tadaka della Tohoku University e i suoi colleghi hanno chiamato jMorp, contiene informazioni su 306 metaboliti e 256 proteine ​​comuni presenti nell'uomo. Ciò include la loro frequenza, concentrazione, e quanto spesso sono apparsi nei maschi o nelle femmine ea quale età. Il database è unico in quanto, invece di visualizzare solo dati grezzi, offre ai visitatori la possibilità di vedere come i diversi metaboliti si correlano tra loro graficamente, aprendo la strada a ulteriori studi per identificare come questi metaboliti e proteine ​​si relazionano tra loro.

"Le informazioni in jMorp sono ottenute da dati statistici creati aggregando dati individuali, " afferma Tadaka. "Un comitato indipendente ha valutato attentamente tutte le questioni etiche prima di consentirci l'accesso a questi dati".

Database simili coprono altri paesi o regioni, come il Regno Unito e la Repubblica d'Irlanda, ma alcuni hanno limitazioni dovute alla raccolta di dati incoerente o alla piccola dimensione del campione. Il gran numero di individui sani che hanno contribuito con campioni a jMorp lo rende particolarmente utile. I ricercatori hanno anche raccolto e analizzato i dati utilizzando lo stesso metodo e presso lo stesso istituto, che riduce al minimo gli errori di misurazione. Inoltre, hanno adottato misure aggiuntive per escludere eventuali campioni di bassa qualità e per garantire il controllo della qualità durante i processi di raccolta, conservare e analizzare i campioni di plasma. Questi rendono jMorp particolarmente affidabile come risorsa per gli scienziati, soprattutto biochimici e ricercatori medici.

Per renderlo rilevante e utile ad altri ricercatori, il team giapponese ha configurato jMorp in un formato intuitivo che consente ai visitatori di raggiungere facilmente i dati di cui hanno bisogno, così come i confronti e le relazioni tra i diversi composti visualizzati visivamente. Gli utenti possono cercare il tipo di composto che stanno cercando per nome o per specifiche. Il riepilogo dei dati può essere scaricato e i grafici di correlazione possono essere salvati come file di immagine.

Il database è uno sforzo continuo e i ricercatori producono versioni annuali aggiornate mentre raccolgono e analizzano più campioni. Hanno anche in programma di offrire maggiori informazioni sui metaboliti e le proteine ​​che documentano applicando nuovi metodi di analisi.