L'H2O ha un punto di ebollizione molto più alto dell'H2Se a causa della differenza nelle loro forze intermolecolari. Le molecole di H2O sono tenute insieme dal legame idrogeno, che è una forte forza intermolecolare. Il legame idrogeno si verifica quando un atomo di idrogeno in una molecola è legato a un atomo altamente elettronegativo, come l'ossigeno o l'azoto. L'atomo elettronegativo attira verso di sé la nuvola elettronica dell'atomo di idrogeno, creando una carica parziale positiva sull'atomo di idrogeno. Questa carica parziale positiva attrae quindi la carica parziale negativa su un altro atomo elettronegativo, formando un legame idrogeno.
Le molecole di H2Se, d'altra parte, sono tenute insieme dalle forze di van der Waals, che sono forze intermolecolari molto più deboli. Le forze di Van der Waals si verificano quando le nubi di elettroni di due molecole si sovrappongono momentaneamente, creando un dipolo temporaneo. Questi dipoli poi si attraggono tra loro, formando una forza di van der Waals.
Poiché il legame idrogeno è una forza intermolecolare molto più forte delle forze di van der Waals, le molecole di H2O sono tenute insieme molto più strettamente delle molecole di H2Se. Ciò significa che ci vuole più energia per rompere le forze intermolecolari tra le molecole di H2O e farle bollire. Pertanto, il punto di ebollizione dell'H2O è molto più alto del punto di ebollizione dell'H2Se.
Oltre ai legami idrogeno, la differenza nei punti di ebollizione di H2O e H2Se può essere attribuita anche alla differenza nelle loro masse molecolari. L'H2O ha una massa molecolare di 18 g/mol, mentre l'H2Se ha una massa molecolare di 80 g/mol. Più pesante è la molecola, maggiore è l'energia necessaria per rompere le forze intermolecolari tra le sue molecole e farla bollire. Pertanto, la molecola di H2Se più pesante ha un punto di ebollizione più alto rispetto alla molecola di H2O più leggera.