L'idrossido di sodio è una base forte che può aumentare il pH di una soluzione. Se l'idrossido di sodio viene aggiunto a una soluzione di pepsinogeno, aumenterà il pH e causerà la conversione del pepsinogeno in pepsina. Tuttavia, la pepsina non sarà attiva in un ambiente con pH elevato e quindi non sarà in grado di scomporre le proteine.
In sintesi, l'idrossido di sodio ha l'effetto di convertire il pepsinogeno in pepsina, ma la pepsina non sarà attiva nell'ambiente a pH elevato creato dall'idrossido di sodio.