Il suo modello, spesso chiamato modello di budino di prugna , raffigurato l'atomo come una sfera di carica positiva con elettroni caricati negativamente incorporati, proprio come prugne in un budino.
Sebbene non del tutto accurato, il modello di Thomson era un significativo passo avanti rispetto ai modelli precedenti, in quanto ha introdotto l'idea di particelle subatomiche e la loro disposizione all'interno dell'atomo.
