La stessa mesosfera non ha un colore. È uno strato di atmosfera terrestre e, come gli altri strati, è trasparente all'occhio umano.

Tuttavia, la mesosfera può apparire nero Di notte, perché c'è pochissima diffusione della luce in quel strato. Durante il giorno, può apparire blu a causa della dispersione della luce solare dall'aria sottile.

Vale anche la pena notare che alcuni fenomeni atmosferici come nuvole noctilucenti sono visibili nella mesosfera. Queste nuvole sono molto alte e appaiono come nuvole luccicanti e argentene.