* ambienti ad alta salinità: Questi includono laghi e lagune ipersalina, in cui l'elevata concentrazione di sale rende difficile prosperare per altri organismi. Esempi includono:
* Shark Bay, Australia occidentale
* Riserva naturale marina di Hamelin Pool, Australia occidentale
* Le Bahamas
* Lagoa Vermelha, Brasile
* Lagoa Salgada, Brasile
* Altri ambienti estremi: Gli stromatoliti possono anche formarsi in altri ambienti estremi, come:
* Hot Springs: Le alte temperature e il contenuto minerale possono limitare la concorrenza.
* ambienti ad alta alcolina: Simile agli ambienti ad alta salinità, l'alta alcalinità può escludere molti altri organismi.
* ambienti High-UV: Alcuni stromatoliti sono stati trovati in aree con alti livelli di radiazioni UV, in cui altri organismi lottano per sopravvivere.
È importante notare che questi ambienti sono spesso fragili e sensibili ai disturbi dalle attività umane, rendendo la conservazione delle moderne stromatoliti una priorità.