Esistono due tipi principali di CBP:LHC (complessi di raccolta della luce) e proteine del centro di reazione PSII (fotosistema II). Gli LHC sono grandi complessi proteici che contengono più molecole di clorofilla e sono responsabili della cattura dell'energia luminosa e del trasferimento al centro di reazione PSII. Le proteine del centro di reazione PSII sono complessi proteici più piccoli che contengono le molecole di clorofilla direttamente coinvolte nelle reazioni chimiche della fotosintesi.
La molecola della clorofilla è un anello di porfirina con al centro uno ione magnesio. L'anello porfirinico è composto da quattro anelli pirrolici collegati tra loro da ponti metinici. Lo ione magnesio è coordinato ai quattro atomi di azoto degli anelli pirrolici e a due atomi di ossigeno dei gruppi propionato della molecola di clorofilla.
La molecola di clorofilla è legata alle CBP attraverso le interazioni tra l'anello porfirinico e i residui amminoacidici idrofobici delle CBP. Lo ione magnesio è coordinato ai quattro atomi di azoto degli anelli pirrolici e a due atomi di ossigeno dei gruppi propionato della molecola di clorofilla. I gruppi propionato interagiscono anche con i residui amminoacidici idrofili dei CBP.
Il legame della clorofilla alle CBP è essenziale per la fotosintesi. Le CBP forniscono un ambiente stabile alle molecole di clorofilla e permettono loro di interagire tra loro e con le altre proteine dell'apparato fotosintetico.