Alghe blu-verdi (cianobatteri) sono conosciuti da secoli. Probabilmente furono osservati anche nei tempi antichi a causa della loro prevalenza in vari ambienti.
La comprensione scientifica delle alghe blu-verdi si è evoluta nel tempo, con contributi significativi di molti ricercatori. Mentre Gregorio Velasquez era un importante botanico e ficologo filippino, è noto per il suo contributo allo studio delle alghe nelle Filippine, in particolare diatomee e altre microalghe, non in particolare alghe blu-verde.