Tuttavia, è importante notare:
* Cornelis Drebbel ha anche affermato di aver inventato un microscopio composto nello stesso periodo.
* Galileo Galilei sviluppato un microscopio composto nel 1609, sebbene fosse più semplice di quello di Janssen.
* Antonie van Leeuwenhoek , sebbene non sia un inventore del microscopio stesso, ha dato un contributo significativo sviluppando potenti microscopi a lenti singoli e usarli per fare osservazioni rivoluzionarie di organismi microscopici.
Pertanto, mentre Zacharias Janssen è spesso considerato l'inventore, la storia del microscopio è complessa e comporta contributi di vari individui.