Credito:CC0 Dominio Pubblico
Per commemorare il Wellcome Trust Sanger Institute che compie 25 anni nel 2018, l'Istituto ei suoi collaboratori stanno sequenziando 25 nuovi genomi. Dalla mora al pettirosso, grillo selvatico alla trota fario, le 25 specie risiedono tutte nel Regno Unito e rappresentano la ricchezza di specie in questo paese. Venti specie sono già state decise, e i restanti cinque saranno votati dal pubblico e dai bambini delle scuole come parte di "I'm a Scientist, Portami fuori di qui'.
I risultati saranno resi pubblicamente disponibili e porteranno a studi futuri per comprendere la biodiversità del Regno Unito e aiutare la conservazione e la comprensione di queste specie.
L'Istituto Sanger è stato fondato nel 1993 dal Professor Sir John Sulston come parte del Progetto Genoma Umano. L'Istituto ha dato il più grande contributo singolo alla sequenza gold standard del primo genoma umano, che è stato pubblicato nel 2003.
Un genoma è l'insieme completo di istruzioni genetiche di un organismo scritte nel DNA. Ogni genoma contiene tutte le informazioni necessarie per costruire quell'organismo e consentirgli di crescere e svilupparsi.
Dal completamento fondamentale del genoma umano, il Sanger Institute è diventato un leader riconosciuto a livello mondiale nel campo della genomica. Sono già stati sequenziati molti più importanti genomi di riferimento:dai genomi di topo e zebrafish al maiale, gorilla, zanzara e molti altri. Al di là delle specie animali, anche le malattie infettive e i batteri occupano un posto di rilievo nell'elenco dei genomi di riferimento, da salmonella e MRSA a clamidia e malaria. Tutti questi hanno offerto importanti spunti su queste specie in salute e malattia.
Ora, il Sanger Institute ei suoi partner stanno sequenziando in modo completo 25 specie dal Regno Unito. Questo progetto è un piccolo contributo a un'impresa molto più grande, dove scienziati di tutto il mondo si stanno unendo per formare un piano per sequenziare tutta la vita sulla Terra.
I genomi di alta qualità apriranno la porta agli scienziati per utilizzare queste informazioni, e i ricercatori potrebbero scoprire come le specie del Regno Unito stanno rispondendo alle pressioni ambientali, e quali segreti nascondono nella loro genetica che consente loro di prosperare, o passera.
Professor Sir Mike Stratton, Direttore del Wellcome Trust Sanger Institute, ha dichiarato:"Venticinque anni fa il campo della genomica era un'idea in erba e le sue implicazioni erano solo sognate. Oggi la realtà della genomica e dei dati biologici è che sta trasformando la nostra comprensione, diagnosi, e cura delle malattie, che vanno dal cancro e malattie cardiache alla malaria e alle infezioni. La scienza e la tecnologia che stanno guidando questa era di scoperte stanno accelerando la nostra comprensione del corpo umano, ma anche del mondo che ci circonda.
Questo progetto è arrivato dopo molte discussioni ponderate in tutto il mondo su quante specie sul nostro pianeta potrebbero essere sequenziate nei prossimi decenni - in linea di principio, tutti loro. Stiamo dando il nostro contributo per mettere in sequenza tutta la vita sulla Terra".
La dottoressa Julia Wilson, Direttore associato del Wellcome Trust Sanger Institute, ha dichiarato:"Attraverso il sequenziamento di questi 25 genomi, gli scienziati acquisiranno una migliore comprensione delle specie del Regno Unito, come sono arrivati qui, la loro evoluzione, e come le diverse specie si stanno adattando a un ambiente che cambia. I risultati potrebbero rivelare verità nascoste in queste specie, e consentirà alla comunità scientifica di comprendere come il nostro mondo sia in continua evoluzione ed evoluzione intorno a noi. Vogliamo celebrare il 25° anniversario dell'Istituto Sanger in un modo speciale 'Sanger', e sono entusiasta di vedere come si svolge il 25 Genomes Project."
Questo progetto è stato reso possibile dalla tecnologia di sequenziamento a lettura lunga PacBio, che genera genomi di alta qualità per l'assemblaggio. L'Istituto sta collaborando con PacBio e altri leader nel settore della tecnologia, 10x Genomica e Illumina, per creare la visione più completa di questi genomi.
Le 25 specie sono suddivise in cinque categorie a seconda delle qualità che condividono:Fiorente, specie in aumento nel Regno Unito; annaspando, specie in via di estinzione e in declino; Pericoloso, specie invasive e dannose; iconico, specie tipicamente britannica che tutti riconosciamo; criptico, specie che sono nascoste o indistinguibili dalle altre in base al solo aspetto.
Tim Littlewood, Il capo delle scienze della vita presso il Museo di storia naturale ha dichiarato:"Il Museo di storia naturale è orgoglioso di collaborare con il Sanger Institute per celebrare il loro 25esimo compleanno e anche per celebrare i progressi che le tecniche molecolari come il sequenziamento del genoma possono apportare allo studio del Regno Unito. fauna selvatica. Gli 80 milioni di esemplari di cui ci prendiamo cura, da tutto il mondo, detengono un patrimonio di informazioni genetiche che ci consente di condurre ricerche innovative, affrontare le sfide globali. Un'attenzione particolare alla biodiversità del Regno Unito con tecnologie all'avanguardia è particolarmente apprezzata".
Finora, venti delle 25 specie sono state decise, e i restanti "cinque grandi" saranno votati dagli scolari e dal pubblico come parte di "Sono uno scienziato, Portami fuori di qui, ' dal 6 novembre all'8 dicembre 2017. Scienziati e team dell'Istituto Sanger, più ampio Wellcome Genome Campus, Museo di Storia Naturale, e altre istituzioni difendono una specie e affrontano il voto del pubblico testa a testa. Gli ultimi cinque classificati completeranno il set di specie da inviare ai sequenziatori.
Lucia Robinson, Il responsabile del programma Citizen Science presso il Museo di storia naturale ha dichiarato:"È fantastico affidare agli studenti delle scuole e al popolo del Regno Unito la direzione della nostra ricerca scientifica. Attraverso la chat con gli scienziati e il voto utilizzando la piattaforma online, possono indirizzare questa ricerca genomica verso le specie e le questioni a cui tengono davvero".