* Geni ribosomiali RNA (rRNA): Questi geni sono essenziali per la sintesi proteica e sono altamente conservati in diversi organismi. Il confronto tra le sequenze di rRNA può rivelare profonde relazioni evolutive.
* Altri geni altamente conservati: I geni coinvolti nei processi cellulari essenziali, come la replicazione del DNA e la trascrizione, sono anche buoni candidati per il confronto.
Perché non altri confronti molecolari?
* Proteine: Mentre le sequenze proteiche possono fornire informazioni sulle relazioni, è più probabile che si evolvessero rapidamente e mostrino connessioni evolutive meno profonde rispetto alle sequenze di DNA.
* Carboidrati: Mentre i funghi, le piante e gli animali hanno strutture per pareti cellulari diverse e composizioni di carboidrati, queste differenze non sono così informative per determinare le relazioni evolutive profonde come le sequenze di DNA.
* Lipidi: I lipidi sono molto diversi e non particolarmente utili per confrontare le relazioni evolutive distanti.
Cosa aspettarsi:
Il confronto delle sequenze di DNA dei geni chiave rivelerà che i funghi sono più strettamente correlati agli animali che alle piante . Ciò potrebbe sembrare sorprendente, ma è supportato da un ampio corpus di prove provenienti da vari campi, tra cui biologia molecolare, struttura cellulare e biochimica.
Nota: Mentre il confronto delle sequenze di DNA è il metodo più affidabile, altri confronti molecolari, come le strutture proteiche o le vie metaboliche, possono fornire informazioni supplementari.