Una grande differenza tra il dominio Eukarya e i batteri di domini e Archaea è la presenza di un nucleo .

* Eucarioti avere un vero nucleo racchiuso da una membrana, che ospita il loro materiale genetico (DNA).

* Batteri e Archaea sono prokaryotes , nel senso che mancano di un nucleo legato alla membrana . Il loro DNA si trova in una regione chiamata nucleoide, ma non è separato dal resto della cellula da una membrana.