1. Legumi: Queste piante, come piselli, fagioli e lenticchie, hanno una relazione simbiotica con batteri che fissa l'azoto chiamati rizobia . Questi batteri vivono in noduli sulle radici dei legumi e convertono l'azoto atmosferico in una forma utilizzabile dalla pianta. Come parte di questo processo, alcuni batteri della rizobia muoiono e si decompongono all'interno dei noduli della radice, contribuendo al processo di decomposizione.
2. Piante micorriziche: Queste piante formano una relazione reciprocamente vantaggiosa con i funghi. I funghi crescono e talvolta penetrano nelle radici della pianta, formando una rete che aiuta la pianta ad assorbire nutrienti e acqua. Alcuni funghi micorrizici ospitano anche batteri All'interno delle loro ife (filamenti), che contribuiscono alla rottura della materia organica nel suolo, rilasciando nutrienti a cui la pianta può quindi accedere.
È importante notare che tutte le piante avere alcuni batteri nelle loro radici, ma la presenza di batteri in decomposizione Nei noduli radicali o sui funghi micorrizici sono specifici per questi due tipi di piante.