1. Il sito attivo:
* Posizione: Una regione tridimensionale specifica sulla superficie dell'enzima.
* Struttura: Composto da residui di aminoacidi che formano una forma unica e un ambiente chimico.
* Funzione: Il sito attivo si lega al substrato, facilitando la reazione chimica.
2. Il substrato:
* Definizione: La molecola su cui agisce l'enzima.
* Specificità: Ogni enzima ha un substrato specifico a cui si lega. Questa specificità è dovuta alla forma e alle proprietà chimiche del sito attivo.
3. La relazione:
* Blocco e modello chiave: Questo modello spiega come il sito attivo e il substrato si adattano insieme. Il sito attivo ha una forma complementare al substrato, consentendo un adattamento preciso.
* Modello di adattamento indotto: Un modello più raffinato, in cui il sito attivo può cambiare leggermente la sua forma per adattarsi al substrato, formando una soluzione perfetta per un'interazione ottimale.
* Interazioni chimiche: L'interazione tra il sito attivo e il substrato non è solo basata sulla forma ma anche su interazioni chimiche come:
* Bond di idrogeno: Obbligazioni deboli tra il sito attivo e il substrato, contribuendo alla specificità.
* Interazioni ioniche: Attrazione tra gruppi accusati di opposizione.
* Interazioni idrofobiche: Regioni non polari sia sull'enzima che sul substrato si uniscono.
4. Il processo catalitico:
* Binding: Il substrato si lega al sito attivo, formando un complesso enzima-substrato.
* Catalisi: L'enzima facilita la reazione chimica, abbattendo il substrato (catabolismo) o costruzione di una nuova molecola (anabolismo).
* Rilascio del prodotto: Il prodotto della reazione viene rilasciato e l'enzima è libero di legarsi a un altro substrato.
In sintesi:
Il sito attivo di un enzima si comporta come un blocco specifico che si adatta solo a una chiave particolare (substrato). La forma e le proprietà chimiche del sito attivo sono cruciali per riconoscere il substrato e facilitare la reazione chimica. Questa misura precisa garantisce un'elevata specificità ed efficienza nella funzione enzimatica.
