Fattori interni:
* Sequenza di aminoacidi: La struttura primaria di un enzima, la sua sequenza di aminoacidi, detta la sua forma tridimensionale. Qualsiasi cambiamento nella sequenza di aminoacidi, dovuti a mutazioni o variazioni genetiche, può alterare la struttura dell'enzima e la sua attività.
* Disulfuro Bonds: Questi legami tra residui di cisteina possono stabilizzare la struttura terziaria di un enzima. Le variazioni del numero o della posizione dei legami disolfuro possono influire sulla forma dell'enzima.
* legami idrogeno, interazioni ioniche, interazioni idrofobiche: Queste forze contribuiscono alla piegatura e alla stabilità della struttura proteica. L'interruzione di queste interazioni può alterare la forma dell'enzima.
* Modifiche post-traduzionali: Le modifiche dopo la sintesi proteica, come la fosforilazione o la glicosilazione, possono influenzare la struttura e l'attività dell'enzima.
Fattori esterni:
* Temperatura: Gli enzimi hanno un intervallo di temperatura ottimale per l'attività. Le temperature estreme possono interrompere il delicato equilibrio delle interazioni che tiene l'enzima nella sua forma attiva, portando alla denaturazione (sviluppo) e alla perdita di funzione.
* ph: Ogni enzima ha un intervallo di pH ottimale. La deviazione da questo intervallo può interrompere le interazioni ioniche e i legami idrogeno all'interno dell'enzima, alterando la sua struttura e attività.
* Concentrazione del substrato: Mentre la presenza di substrato non cambia la forma dell'enzima, elevate concentrazioni di substrato possono saturare l'enzima, causando un cambiamento nella sua forma generale.
* inibitori: Gli inibitori competitivi si legano al sito attivo di un enzima, prevenendo il legame del substrato e alterando la sua forma. Gli inibitori non competitivi si legano a un sito diverso sull'enzima, causando un cambiamento conformazionale che colpisce il sito attivo.
* Attivatori: Alcuni enzimi richiedono cofattori (molecole non proteine) o coenzimi (molecole organiche) per funzionare. Queste molecole possono legarsi all'enzima e indurre un cambiamento conformazionale, consentendo una funzione corretta.
* denaturants: Questi agenti, come acidi forti, basi, detergenti o metalli pesanti, interrompono i legami deboli che tengono insieme la struttura dell'enzima, portando alla denaturazione.
È importante ricordare che la struttura determina la funzione negli enzimi. Qualsiasi alterazione della forma dell'enzima può influire sulla sua capacità di legarsi al suo substrato e catalizzare la reazione. Questo cambiamento di forma può comportare una ridotta attività, una completa inattivazione o persino un cambiamento nella specificità dell'enzima.