* 9 + 2 Disposizione dei microtubuli: Entrambe le strutture hanno un nucleo di microtubuli disposti in uno schema specifico. Ci sono nove coppie di microtubuli disposti su un anello attorno a una coppia centrale. Questa disposizione è chiamata struttura "9 + 2".
* corpo basale: Sia le ciglia che la flagella provengono da un corpo basale, che è una struttura che li ancora alla cellula. Il corpo basale è anche strutturalmente simile a un centriolo.
* Dynein Arms: Questi motori molecolari sono attaccati ai microtubuli e usano ATP per generare la forza per il movimento.
* Membrana al plasma: Entrambe le strutture sono coperte da una membrana plasmatica, che è una continuazione della membrana plasmatica della cellula.
Queste caratteristiche condivise indicano un'origine evolutiva comune e un meccanismo di movimento.