Ecco perché:
* Il DNA è una molecola a doppio filamento: Ogni filamento è composto da una sequenza di nucleotidi (adenina, guanina, citosina e timina).
* Regole di accoppiamento di base: L'adenina (A) si accoppia sempre con la timina (T) e la guanina (G) si accoppiano sempre con la citosina (C). Questo si chiama accoppiamento di base complementare.
* Ibridazione: Una sonda etichettata, che è una breve sequenza di DNA a singolo filamento, può legarsi alla sua sequenza complementare all'interno di una molecola di DNA più lunga (il gene target) attraverso queste interazioni di accoppiamento di base.
In sostanza, la sonda e il gene target "riconoscono" a vicenda in base alle loro sequenze di nucleotidi complementari, permettendo loro di legarsi insieme. Ciò costituisce la base di varie tecniche come Microarrays Southern Blotting, PCR e DNA, che si basano sull'ibridazione per il rilevamento e l'analisi.